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MOEからサードパーティーソフトウェアを実行するためのインターフェースも簡単に作成できます。

絶版品　HILLSFIELD 　俺のMOKKIN ゼブラ（ウォルナット＆オーク)では、実際に弊社で開発したSVLプログラムを公開しています。また、CCG社のMOEユーザー向けフォーラムでは、世界中のMOEユーザーが作成したSVLプログラムを入手できます。

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アプリケーションをウェブブラウザーから利用できるモードです。MOE/webはジョブ管理や履歴機能を搭載したウェブサービスを内蔵しているため、他のサービスを利用することなく容易に設置できます。SVLを用いて新しいMOE/webアプリケーションを追加することも可能で、直接MOEを使用しない実験研究者などが気軽に使える計算化学環境を作ることができます。

• MOE/web アプリケーション例
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• ■ 分子の物性推算
• ■ 分子スケッチャー
• ■ アミノ酸配列のホモロジー検索
• ■ 抗体モデリング
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MOEの一部のアプリケーションをサーバー上で行うためのモードです。ファーマコフォア検索やFBDD用の検索対象データベースや、MOE Projectデータベースなどの比較的容量の大きい分子データベースをローカルに配置せずMOE/webサーバー上に配置しネットワークを介して検索・参照できます。計算コストやファイル容量において、ローカルマシンの負荷を削減することできます。

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MOE/smpは別プロセスでの分散処理を行うモードです。同一マシン上の別CPUやコア、sshプロトコルを経由したLAN内の別ノードを利用した分散処理が可能です。ドッキング計算やホモロジーモデリング、化合物ライブラリーの配座解析など対応したアプリケーションを高速に処理することができます。

MOEはデスクトップPCやノートPCによる通常利用のほかに社内システムへの組み込みも可能です。OSは、Windows、Mac、Linuxに対応しています。